教會合一的努力 西元1261年尼西亞皇帝邁克•帕里奧洛格（Michael Palaeologus）從拉丁人手中奪回君士坦丁堡，東正教的宗主教再次佔有聖索非雅大教堂的教區。從1261年到1453年，拜占庭帕里奧洛格王朝所統治的帝國多次四圍環敵，又因內戰導致分裂，領土慢慢縮小到只剩下王城一地。而教會則保住絕大多數的教區，將管轄權推展到帝國範圍之外，包括俄國及遙遠的高加索山、巴爾幹的一部份，還有被土耳其佔領的大部分區域。許多後期的宗主教，例如亞瑟尼斯•奧圖安（Arsenius Autorianus, 1255-59, 1261-65年在位）、亞大拿西一世（Athanasius I, 1289-93, 1303-10年在位）、約翰•克拉克（John Calecas, 1334-47年在位），以及費留克西斯（Philotheus Coccinus, 1353-54, 1364-76年在位），都已不理會皇室權威，但心中仍然忠於拜占庭。 因為缺乏軍事力量作為後盾，君士坦丁堡教區的統治難以有效到達早在拉丁人統治時就已獨立自主的保加利亞和塞爾維亞教會。到了1346年，塞爾維亞的教會甚至公然宣告自己為獨立的教區；歷經短暫的抗議無效，君士坦丁堡只好在1375年接受此一事實。在俄國，拜占庭的教會間陷入嚴重的內鬥，起因於莫斯科和立陶宛的大公爭相帶領俄羅斯掙脫蒙古的枷鎖。當時的「基輔暨全俄羅斯大主教」早已駐守在莫斯科，並在政府事務中扮演重要角色，包括大主教亞阿力克賽（Alexis, …
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